新疆天文台建于1957年，原名为中国科学院乌鲁木齐人造卫星观测站，1987年更名为中国科学院乌鲁木齐天文站，2001年4月更名为中国科学院国家天文台乌鲁木齐天文站，2011年1月更为现名。新疆天文台是中国综合性天文台之一，是中国西部地区唯一的天文研究机构。
新疆天文台现有射电天文、光学天文以及计算机技术三个专业研究室，同时设有中国科学院射电天文重点实验室（分部）、新疆射电天体物理重点实验室、新疆微波技术重点实验室、科技部射电天文与技术国际联合研究中心、中国—中亚天文学史联合研究中心、新疆大学—国家天文台联合天体物理中心等机构。
新疆天文台研究方向涵盖了脉冲星辐射特性及引力波探测、恒星形成与演化、星系宇宙学、天体化学、高能天体物理、光学时域天文和大视场巡天、太阳物理、空间目标与碎片和天文技术与方法等，同时承担了深空探测、北斗导航、量子通信等国家重大任务。通过聚焦前沿、凝练特色，在射电天文多个学术热点领域取得了高水平研究成果。不断追求学术卓越和技术创新，围绕国家重大科学需求，积极开展了超宽带微波信号接收、射电望远镜结构与控制、数字信号处理以及天文大数据管理等方面的技术与设备研发工作，有效增强了对天文学前沿研究的支撑能力。
新疆天文台运行有南山、奇台、慕士塔格、喀什四个基地型野外观测站，主力观测设备有南山26米、25米，喀什13米等射电望远镜，南山1米、1.2米等光学望远镜集群，这些设备除了开展天文学基础研究以外，还承担了多项国家重大观测任务，有力支撑了我国天文与空间科学等相关领域的发展。
新疆天文台坚持人才引进与自主培养并重的人才策略，通过优化固定人才、吸引柔性人才、聘用流动人才、创新教育培养模式等形式，凝聚了一批有理想有热情的青年科技人才投身天文事业。
新疆天文台是新疆天文学会的挂靠单位，是全国、自治区和乌鲁木齐市的科普工作先进集体，开展了层次丰富、形式多样的科普活动，年均受益约5万人次。通过普及天文科普知识，践行文化润疆要求，提升了社会公众的科学素养，对冲了宗教极端思想影响，努力为新疆社会稳定和长治久安做出了积极贡献。
