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研究所于1973年12月成立，2020年11月加挂“生态环境部生态环境应急研究所”牌子，是生态环境部直属、从事综合性生态环境科学研究的公益性科研机构。华南所（应急所）秉承“筚路蓝缕 厚德远志 惟实求真”的所训和倡导“忠诚担当 求真务实 专业创新”的文化，面向国家前瞻性生态环境问题开展科学研究，为国家生态环境保护事业提供科技支撑，为区域生态环境质量改善提供技术服务。
华南所（应急所）围绕科学研究、管理支撑、科技服务三大使命和任务，形成海洋生态环境、生态环境治理修复和固废管理、生态环境风险与应急、环境健康与化学品风险管理4个特色学科群和1个公共服务型学科组团，拥有4个省部级重点实验室，2个省部级工程实验室，3个省部级工程中心，6个科学观测研究站，1个区域性二噁英监测中心，1个博士后科研工作站。华南所（应急所）是国家环境损害鉴定评估、固体废物属性鉴别推荐机构，华南环境损害司法鉴定中心依托单位，广东省重点智库；是中国环境科学学会环境风险专业委员会、海洋生态安全专业委员会、生态环境修复专业委员会，中国环境保护产业协会二噁英污染防控委员会的依托单位。“十三五”以来，获得国家科技奖6项，省部级科技奖近30项。
华南所（应急所）具有野外监测、仿真模拟、检测分析、技术研发、装备研制等全链条决策支持能力；具有中国计量认证（CMA）和中国合格评定国家认可委员会认证（CNAS）双重资质，通过国家计量认证分析项目15大类3000余项监测指标，服务区域遍及全国。
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