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研究院是省科技厅为推进江苏沿海开发，2008年1月批准建设的以江苏海洋大学为依托单位的省级涉海重大研发机构。2013年1月，以江苏海洋大学和连云港市科技局为举办单位，获批连云港市法人事业单位，2015年获批国家级博士后科研工作站。
研究院也是江苏海洋大学“江苏省海洋生物产业技术协同创新中心”、江苏省海洋生物资源与环境重点实验室的建设主体。获评连云港市产学研先进单位、连云港国家高新区创新单位、连云港市科技创新奖单位奖等奖项多次。已建成集人才培养、科技研发、成果转化、企业孵化、技术服务为一体的省级科技公共服务平台。
研究院建有省科技厅江苏省海洋生物资源与环境重点实验室、绿色过程与工程研发中心、分析测试中心，省发改委江苏省海洋生物资源利用与质量安全控制工程中心、江苏省海洋智能装备工程研究中心、江苏省智慧港口工程研究中心，省经信委江苏省中小企业海洋生物产业技术公共服务平台，连云港市海洋资源利用功能材料重点实验室、连云港市海洋生物医药与制品重点实验室等省市级研发平台10余个。现有仪器设备300多台套，总值2000多万元，年服务企业100多家。
研究院主持和参与各类科研项目190余项，年科研经费3000多万元。获授权专利70多件，成果获省科技进步奖、国家海洋科技创新二等奖等市级以上奖项10多项。转让成果多件，多项成果在企业推广、转化应用，为企业实现产值超亿元，有效促进了地方经济的发展。
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