江苏省中医药研究院、江苏省中西医结合医院始建于1956年。2013年6月，成为中国中医科学院首个地方分院，2023年7月，增挂“江苏省职业病医院”，是专业从事中医药研究的省属公益类科研机构、综合性三级甲等中西医结合医院，同时还是南京中医药大学附属中西医结合医院、第三临床医学院，是全国首批重点中西医结合医院、国家药物临床试验机构、国家中医类别全科医师规范化培训基地、国家中医住院医师规范化培训重点专业基地、国家中医紧急医学救援队伍及基地依托医院、江苏省中医综合类紧急医学救援基地、美国心脏协会（AHA）授权的专业急救技能培训基地。
2017年入选全国中医药传承创新工程省级中医药科研机构项目储备库，2018年成为国家中医临床研究基地建设单位，2022年被列入国家中医药传承创新中心项目储备库，获批成为江苏省公立医院高质量发展省级试点建设单位。
通过多年的建设发展，研究院拥有研究体系完整、设施设备先进、研究能力较强的中医药科研平台，包括国家中医药管理局中药（口服制剂）释药系统重点研究室、国家中医药管理局瘿病证治重点研究室、江苏省现代中药制剂工程技术研究中心、省天然药物研究与创制实验室、国家专利产业化江苏中医药试点基地等。
2017年获科技部“重大新药创制”专项计划3项。国家中医药管理局中药（口服制剂）释药系统重点研究室获批省医学创新团队。2021年成功获批国家杰出青年科学基金项目、江苏省医院中药制剂工程研究中心和江苏省中医消化肿瘤临床医学创新中心。2022年获批江苏省临床中药学交叉医学创新中心。2023年获批江苏省中医药临床转化公共服务平台。先后研发了国内首个复方中药注射剂脉络宁，以及月月舒、乳康舒胶囊等中药新药。着力实施名老中医临证经验和学术理论传承创新，依托名老中医工作室，挖掘整理名老中医经验方，积极推进医院制剂研发，两个中药新药获批国家药审中心临床试验默示许可。
