一个以水稻为主要研究对象的多学科综合性国家级研究所。1981年6月经国务院批准在杭州建立，1989年10月落成，是建国以来我国一次性投资最大的农业科研机构。现隶属于中国农业科学院和浙江省人民政府双重领导。2002年经科技部等部门批准为非营利性农业科研机构。
研究所以应用基础研究和应用研究为主，着重解决稻作生产中的重大科技问题。具有从事水稻群体、个体、组织、细胞、分子等各层次的科研能力。研究所主要从事应用基础研究和应用研究。主要任务是： （一）水稻种质资源的收集、保存、评价和种质创新与利用；
（二）水稻重要基因的挖掘利用；
（三）水稻育种新技术创新与新品种选育；
（四）水稻栽培与耕作研究；
（五）水稻生产突发问题应急攻关；
（六）水稻品质安全与决策咨询服务。
研究所位于杭州市，拥有一个包括实验室群、试验农场等在内的科学实验基地，占地 5300 余亩。建有科学实验楼、图书信息楼、生物工程楼、水稻种质库、人工气候箱群、温室、访问科学家与进修培训人员宿舍及其他配套设施，总建筑面积 11 万平方米。实验室中配备有近 3亿元的仪器设备。在海南陵水县建有海南试验中心。在黑龙江宝清县建有北方水稻研究中心。
研究所遵循 " 立足浙江、面向全国、放眼世界 " 的办所方针，积极承担来自国家、农业农村部、浙江省、中国农业科学院和国际合作等立项渠道的科研任务。至 2023 年12月，研究所共取得省部级以上获奖成果 151项次，国家级获奖成果 25 项，涵盖了国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖三大奖项。
编辑出版《中国水稻科学》、《Rice Science》、《中国稻米》期刊及大型水稻学术专著；建有中国水稻信息网（www.cnrri.org、www.chinariceinfo.com）。图书馆拥有中外藏书4万余册。
