中心是在国家科技部和上海市人民政府的支持下，于 2000 年初由上海市科委、上海市浦东新区政府和上海张江（集团）有限公司共同投资组建的中药现代化研究开发机构，是国家生物医药基地重点建设的“一所六中心”之一， 是国家生物医药基地重点建设的国家级专业孵化器，也是国家国际科技合作基地和上海市研究生联合培养基地。
中心自成立之日起，就致力于我国的中药现代化事业和创新药物研究，将现代生命科学、化学和信息科学与传统中医药的历史积累相互渗透和交融，逐步建立起“知物、知因、知理”的新型药物创新研发体系，并努力将传统中药发展成为知识经济的重要组成部分。目前中心建有一支以博士、硕士为业务骨干的近 60 人的研发队伍，不但建有功能较为齐全的新药创新研发体系：中药信息、植化提取、分析测定、化学合成、药理毒理、中药基因组、药物设计、公斤级中试车间等实验室，而且还成功搭建了中医药研发信息服务公共平台、中药基因组学药物筛选平台和皂苷类化学药物合成平台，并拥有NMR、HPLC、GC/MS、LC/MS、PCR、紫外光谱仪、SPF 级动物房等现代化大型仪器设备；先后承担并顺利完成了国家科技攻关计划重大专项、国家863计划重大项目、国家新药创制重大专项、国家国际科技合作重大项目和上海市重大科技行动计划等一大批具有较高科技内涵和较大发展潜力的研究项目，为创新药物的后续发展积累了较雄厚的科研基础和研发实力。
目前已申报一类新药临床批件2项、新中药1项，其中有2项正在进行临床试验研究，另有境外上市新药1款，保健产品若干个；申请国家发明专利35项、其中已获授权专利14项，申请国际专利11项、其中已获美国、日本授权专利各1项。 作为国家级专业孵化器，中心还培育孵化出若干个有活力、富潜力的生物医药类企业。
根据中心的自身专业特长与技术优势，通过完善创新机制，构建功能平台，积极开展多层次的技术服务，为上海市尤其是张江园区众多生物医药企业的发展壮大作出了贡献；并与国外很多知名院校、跨国企业建立了紧密的合作关系，赢得了信誉、品牌和知名度，为创建集科研开发、技术服务、信息交流、风险投资于一体的大型中药现代化研发实体做了坚实的铺垫。
